اولاً، دمای بهینه برای خنک کردن آب و اتلاف گرما کمتر نیست، بهتر است.در مرحله دوم، سه شرط مهم وجود دارد که عملکرد کل سیستم خنک کننده آبی را تعیین می کند:

1. هدایت حرارتی مواد رسانای حرارتی (تعیین شده توسط مواد اجزایی مانند سر سرد و ردیف سرد).

2. سطح تماس سطح رسانای حرارتی (تعیین شده توسط تعداد کانال های آب سرد و ضخامت ردیف سرد).

3. اختلاف دما (عمدتاً توسط دمای اتاق، تعداد مبدل های سرد و نرخ جریان پمپ آب تعیین می شود).

حاصلضرب این سه شرط، اتلاف حرارت در واحد زمان کل سیستم خنک کننده آبی است.می توان مشاهده کرد که اندازه جریان پمپ آب فقط شامل اختلاف دما می شود، اما تفاوت دما صرفاً توسطپمپ آبنرخ جریان.در یک سیستم خنک کننده با آب، اختلاف دمای بهینه، اختلاف دمای بین دمای هسته و دمای اتاق است.پس از رسیدن به این تفاوت، افزایش دبی پمپ آب در واقع بهبود خاصی خواهد داشت، اما برای عملکرد کل سیستم ناچیز است.و در حال حاضر بهترین پمپ آب در سیستم های کامپیوتری با حداکثر ولتاژ منبع تغذیه 12VDC40M است و بسیار کم صدا است.برای پمپ های پرقدرت، ابتدا باید ولتاژ منبع تغذیه خود را تنظیم کنید.ثانیاً، افزایش نرخ جریان منجر به افزایش فشار بر دیواره داخلی کل سیستم، کاهش عمر مفید آن و افزایش خطرات عملیاتی می شود.بنابراین پمپ با قدرت بالا غیر ضروری است.